размер термопрокладки
Размер должен быть такой, что бы с запасом накрывать кристалл.
А вот толщину, скорее всего подбирать экспериментально нужно будет. Но, на сколько я помню, там немногим меньше миллиметра. В любом случае, можно взять по-толще, но мягкую прокладку, т.е. не как резина, а такую, которая при избыточном давлении лишнюю свою часть выдавит за кристалл, тем самым станет нужной толщины.
Так же, хочу заметить, что термопрокладки бывают разные по теплопроводности, и т.к Вам нужна прокладка на ГПУ - Вам необходима максимально качественная. Советую обратиться в ближайший сервисный центр и попросить подобрать прокладочку, не думаю, что за это много попросят, если попросят вообще.